มหาวิทยาลัยพะเยาได้ทำบันทึกข้อตกลงความร่วมมือในการผลิตและพัฒนากำลังคนด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพ ระหว่างกระทรวงสาธารณสุข
และมหาวิทยาลัยพะเยา ลงวันที่ 28 ธันวาคม 2552 ว่าจะร่วมกันผลิตและพัฒนาบุคลากรด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพที่มีคุณภาพมาตรฐานให้โรงพยาบาล
ในสังกัดกระทรวงสาธารณสุข โดยการจัดการเรียนการสอนตามหลักสูตรแพทยศาสตรบัณฑิตและได้จัดตั้งศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิก
โดยมีโรงพยาบาลนครพิงค์ จังหวัดเชียงใหม่และโรงพยาบาลพะเยา จังหวัดพะเยา เป็นโรงพยาบาลหลักในการร่วมผลิตบัณฑิตแพทย์
ศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิก โรงพยาบาลนครพิงค์ ก่อตั้งขึ้นภายใต้โครงการผลิตแพทย์เพิ่มเพื่อชาวชนบท
หรือ (the Collaborative Project to Increase Production of Rural Doctor : CPIRD) ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2556 เป็นศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิก
ลำดับที่ 36 ของประเทศไทย เพื่อแก้ปัญหาการขาดแคลนแพทย์และการกระจายแพทย์ที่ไม่เหมาะสมในชนบท และได้ลงนามความร่วมมือ
อย่างเป็นทางการกับคณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยพะเยา ในวันที่ 1 พฤษภาคม 2556 (ไฟล์บันทึกข้อตกลง)
โดยจัดการเรียนการสอนชั้นปรีคลินิก ปีที่ 1 - 3 ที่คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยพะเยา และชั้นคลินิกปีที่ 4-6 ที่ศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิก
โรงพยาบาลนครพิงค์ เริ่มรับนิสิตแพทย์ชั้นคลินิกในปี 2556 เป็นปีแรก จำนวน 10 คน และปัจจุบันตั้งแต่ปี 2568 รับนิสิตแพทย์ชั้นคลินิก ปีละ 48 คน
ศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิก โรงพยาบาลนครพิงค์ ผลิตแพทย์ประจำบ้านหลักสูตรหลังปริญญา 5 สาขาวิชา ได้แก่
1. หลักสูตรผู้เชี่ยวชาญสาขาศัลยศาสตร์
2. หลักสูตรผู้เชี่ยวชาญสาขาศัลยศาสตร์ออโธปิดิกส์
3. หลักสูตรผู้เชี่ยวชาญสาขากุมารเวชศาสตร์
4. หลักสูตรผู้เชี่ยวชาญสาขาเวชศาสตร์ฉุกเฉิน
5. หลักสูตรผู้เชี่ยวชาญสาขาอายุรศาสตร์
ข้อมูล ณ วันที่ 26 มกราคม 2569